L'Institut des Sciences de la Vigne et du Vin Bordeaux Aquitaine est largement ouvert aux collaborations nationales et internationales sur des problèmes d’intérêt général : adaptation au changement climatique, réduction des produits phytosanitaires, typicité des vins. De nombreux contacts et collaborations avec les principaux centres européens et mondiaux actifs en matière de recherche vitivinicole, et les principaux marchés d’exportation sont établis.

Ces contacts se traduisent par divers programmes de recherche collaboratifs financés au niveau national (Programmes ANR, CASDAR, France Agrimer, métaprogramme de l’INRA sur l’adaptation au changement climatique) et international (Allemagne, Espagne, Portugal, Hongrie, Bolivie, Chili,….).

Les équipes de recherches sont également mobilisées dans le cadre du 7ème PCRD (Programme Cadre Recherche et Développement) de l'Union Européenne (coordination d’un groupe de travil au sein du projet Innovine KBBE, soumis) et dans les projets d’investissement d’avenir (soumission de l’Equipex EVE : Ecosystème Viticole et Environnement, en cours d’évaluation), participation au projet Vitinext (en cours d’évaluation), participation au Labex COTE sur les écosystèmes estuariens, forestiers et viticoles (accepté). Par aileurs, en présentant des projets sur des appels d’offres compétitifs, l’ISVV Bordeaux Aquitaine est aussi régulièrement soutenu par le Conseil Régional d’Aquitaine, le CIVB (Conseil Interprofessionnel du Vin de Bordeaux), le CIVC (Conseil Interprofessionnel du Vin de Champagne, France Agrimer, la Fondation Poupelain (Cognac), et de nombreuses PME du secteur vitivinicole.

Par ailleurs, l'Institut des Sciences de la Vigne et du Vin a lancé depuis 2007 un système de bourses pour accueillir de jeunes chercheurs étrangers (ISVV Travel Grant).